La Chiesa è stata realizzata nel 1744 da Francesco Maria Ruspoli Principe di Cerveteri, che acquistò il feudo di Riano dalla famiglia Cesi nel 1710.
Per la costruzione della chiesa il Principe Ruspoli si rivolse all?architetto Carlo Marchionni (1702-1786) uno degli architetti più rinomati di Roma in quel periodo.
Il Marchionni già nel 1756 divenne responsabile dell?amministrazione camerale nella fabbrica di S. Pietro, subentrando poi al Vanvitelli alla guida della stessa Fabbrica.

La chiesa, anticamente chiamata ?Chiesa di Procoio?, è stata successivamente dedicata a S. Francesco.

Alcune decorazioni come stucchi e nicchie furono abolite dal progetto originario per contenere la spesa iniziale, lasciando tuttavia lo stile sacro e ?rurale? dove poter seguire le funzioni senza recarsi alla Chiesa di Riano. D?altronde una chiesa nel borgo esisteva già, fu il Principe a volerla ricostruire più grande e indipendente dal casale adiacente, con quell?eleganza decorativa tanto cara all?architetto C. Marchionni.

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